Bio-informaticien - H/F

Eurofins France Clinical Diagnostics - Biomnis
Lyon
Description de l'entreprise

EUROFINS SCIENTIFIC (6,9 milliards d’euros de chiffre d’affaires en 2024 et figurant parmi les valeurs les plus performantes d'Europe depuis 20 ans), est le leader mondial des services bio-analytiques. Avec environ 65 000 collaborateurs à travers un réseau entrepreneurial et décentralisé de plus de 950 laboratoires dans plus de 1 000 entreprises et dans 60 pays, Eurofins dispose d’un portefeuille de plus de 200 000 méthodes d’analyse.

Les laboratoires qui composent le Groupe Eurofins sont engagés dans une recherche permanente de l'excellence pour fournir à leurs clients des résultats d’analyse fiables dans les meilleurs délais. La fiabilité et la précision des données analytiques permettent à nos clients de prendre les décisions appropriées au regard des risques encourus, tout en répondant aux normes de qualité et de sécurité en vigueur. Nous partageons tous la même mission au sein du réseau Eurofins: contribuer à la santé et la sécurité de tous ! #TestingForLife

Intégré au réseau Eurofins, le laboratoire Eurofins Biomnis, fort de ses 3 000 examens disponibles, a fondé sa réputation sur le développement continu de nouveaux tests et la réalisation d’analyses à forte valeur ajoutée médicale. Eurofins Biomnis intervient dans tous les domaines de la biologie et les examens sont exécutés à l’aide des techniques les plus récentes, qui nécessitent le plus souvent des mises en œuvre complexes, des experts hautement qualifiés et des équipements sophistiqués.

Rejoignez les équipes dynamiques d’Eurofins Biomnis, le leader français de la biologie médicale spécialisée !

Description du poste

Dans un contexte de renforcement de notre activité de séquençage à haut débit (production et développement), nous recherchons, en CDI, un(e) :

Bio-informaticien – H/F

L’équipe de bio-informatique, constituée de 3 bio-informaticiens + 1 technicien bio-informatique, a pour but de mettre en place les pipelines d’analyse de données (notamment de séquençage), afin de permettre leur interprétation par les biologistes et scientifiques s’intéressant à différentes thématiques médicales : génétique constitutionnelle, oncologie, infectiologie…

Vos missions seront les suivantes :

  • Veiller au bon déroulement des pipelines d’analyses de production
  • Participer à la résolution des problèmes et répondre aux interrogations des biologistes et scientifiques
  • Développement de nouveaux pipelines d’analyses de données, intégration à l’environnement de production, qualification selon la norme ISO15189 et montée en version
  • Evaluer les outils bio-informatiques existants et apporter des nouvelles solutions pour l’analyse de données diverses (ADN, ARN, short reads, long reads …), en réponse à différence questions médicales.
  • Participer à la cartographie et à l’optimisation des processus bio informatiques

Qualifications



Vous avez validé un Master en bio-informatique ou équivalent, vous disposez de connaissance en génétique humaine et en analyse de données de séquençage haut-débit.

La maitrise de différents langages de programmation (R, Python) et d’un interprétateur de commandes (Bash/Shell) est indispensable. La maitrise du gestionnaire de workflow Nextflow, ainsi que d’outils de visualisation sera appréciée. Les formats courants lors de l’analyse de données de séquençage (fastq, vcf, bam …) vous sont familiers. 

Des connaissances avancées en statistiques et intelligence artificielle seront appréciées, ainsi qu’une expérience passée en laboratoire de diagnostic médical.

Votre capacité d’adaptation, votre curiosité et votre bienveillance vous permettront de travailler en collaboration avec les biologistes et scientifiques des équipes de génétique constitutionnel, oncologie et infectiologie.

Enfin, la connaissance de l’anglais écrit et oral est indispensable pour être en réussite sur ce poste.

Nous cherchons une personne enthousiasmée par la perspective de déployer des outils innovants dans le cadre du diagnostic de précision !

Eurofins Biomnis est engagé dans une politique en faveur de l'insertion des travailleurs handicapés. Une adaptation au poste selon les profils sera toujours étudiée.

Informations supplémentaires

Poste à temps plein

Plage horaire : du lundi au vendredi

Localisation : Lyon 7ème

Prise de poste : dès que possible

Statut : cadre

 

Rémunération et avantages :

Salaire annuel brut selon expérience

Restaurant d’entreprise

RTT

Accord de participation et d’intéressement

Accord relatif au télétravail

Prime de cooptation

Diverses actions QVT (participation à des évènements sportifs et caritatifs, etc.)

 

REJOIGNEZ-NOUS !

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